Génomique immunitaire de précision dans la transplantation rénale pédiatrique : une nouvelle application de l'échantillonnage adaptatif par nanopores pour une stratification génomique intégrée des risques
Établissement : Université de la Colombie-Britannique
Années : 2026-2027
Sujet(s) : Transplantation
Résumé grand public
La greffe rénale offre aux enfants atteints d'insuffisance rénale la possibilité de mener une vie plus longue et en meilleure santé, mais le système immunitaire de chaque enfant est différent. Certains enfants développent un rejet précoce ou une inflammation persistante qui endommage leur rein greffé, tandis que d'autres réagissent très bien au traitement standard. À l'heure actuelle, nous ne disposons pas des outils nécessaires pour prédire, avant la greffe, quels enfants présentent un risque immunitaire intrinsèquement plus élevé, ce qui empêche les cliniciens d'adapter le traitement immunosuppresseur à chaque enfant.
Relever ce défi est au cœur de la vision du CDTRP : personnaliser un système immunitaire optimal pour chaque patient. Cette étude examinera 42 variations sur 28 gènes liés au système immunitaire dans des échantillons d’ADN provenant de 200 enfants ayant bénéficié d’une greffe rénale en Colombie-Britannique. Chaque variante génétique a été associée individuellement à un rejet ou à un échec de greffe dans d’autres études; cependant, nous proposons de comprendre comment elles interagissent globalement pour façonner la réponse immunitaire globale de chaque enfant après la greffe.
À l’aide de l’échantillonnage adaptatif Oxford Nanopore, une nouvelle stratégie de séquençage, nous établirons des profils de risque génétiques individuels et les relierons à des résultats cliniques concrets : biopsies rénales, marqueurs inflammatoires urinaires et survie à long terme du greffon. L’apprentissage automatique permettra d’identifier les combinaisons de variants qui prédisent le mieux le rejet précoce, l’inflammation de l’allogreffe et l’échec du greffon.
Il en résultera un score de risque immunitaire personnalisé avant la transplantation, destiné à orienter la sélection du donneur, l’intensité de la surveillance et l’ajustement de la posologie des immunosuppresseurs pour chaque enfant. Les patients, leurs familles et les donneurs sont étroitement associés à l’ensemble de ce travail; ils participent à l’élaboration conjointe de l’interprétation et de la communication des résultats, et veillent à ce que cet outil d’évaluation du risque génétique soit pertinent, fiable et prêt à être mis en œuvre dans la pratique clinique. Cette approche de précision soutient directement la mission du CDTRP, qui consiste à faire évoluer la médecine de la transplantation d’une prise en charge réactive vers des soins proactifs et individualisés.
